E01 · Pilotoseptiembre 2002
E02 · Lazos de sangreseptiembre 2002
E03 · Doe Re: Meoctubre 2002
E04 · Pasado imperfectooctubre 2002
E05 · John Deuxoctubre 2002
E06 · Arte menorLa confianza de Doe en Karen es cuestionada tras ser sospechosa del robo de una pieza de arte.
noviembre 2002 E07 · EstratagemasUna madre con su hijo aparecen en la puerta de John, diciéndole que él es su padre.
noviembre 2002 E08 · Idahonoviembre 2002
E09 · Destino manifiestodiciembre 2002
E10 · El dolientediciembre 2002
E11 · John Doe cadáverContinuación y conclusión del episodio anterior.
enero 2003 E12 · Muerte silenciosaJohn investiga el asesinato de un DJ.
enero 2003 E13 · Padre de familiaTras una serie de secuestros, la policía acude a Doe para que les ayude a encontrar al culpable.
enero 2003 E14 · Polvo eresCuando Karen es secuestrada por la Organización Phoenix, John ha de volver a Horseshoe Island.
febrero 2003 E15 · Conexión psíquicaUn escéptico Doe se une a un físico para resolver un caso.
marzo 2003 E16 · El intrusomarzo 2003
E17 · Actúa o muereUn agente resentido amenaza con propagar la viruela por el país.
marzo 2003 E18 · Guardar como... John DoeLa búsqueda de inteligencia artificial puede tener una conexión directa con el pasado de Doe.
marzo 2003 E19 · Sobrecarga en el sistemaabril 2003
E20 · Control remotoabril 2003
E21 · La ascensiónabril 2003
