E01 · Premiere El Comandante John Crichton se dispone a probar un nuevo diseño de lanzadera espacial cuando una anomalía de origen desconocido le arrastra lejos de la Tierra para aparecer en medio de una batalla entre naves alienígenas. Allí se ve forzado a unirse a una tripulación de presos en fuga en su propia nave prisión, que para colmo es un ser vivo. marzo 1999 · 50 min
E02 · Yo, E.T. Por culpa de un artefacto Pacificador Moya empieza a emitir una señal de localización. Para amortiguarla mientras la eliminan intentan una maniobra muy arriesgada: aterrizar en un planeta desconocido. marzo 1999 · 50 min
E03 · Éxodo del Génesis Unos parásitos se cuelan en Moya y ponen en peligro la nave y sobre todo la vida de Sun. Además crean réplicas de los tripulantes de la nave que siembran el caos. Por si fuera poco, sube a bordo una nave Pacificadora. abril 1999 · 52 min
E04 · Trono para la perdición Rygel es secuestrado por una banda de mercenarios. El problema radica en que se ha llevado consigo una pieza sin la que Moya no puede maniobrar, así que la tripulación, muy a su pesar, debe intentar rescatarlo. abril 1999 · 50 min
E05 · Regreso y regreso al futuro Tras el rescate de una nave de salvamento Crichton empieza a tener extrañas visiones que parecen ser el futuro. Mientras, la tensión crece tras el rescate de los supervivientes. abril 1999 · 50 min
E06 · Gracias a dios es viernes, otra vez D’Argo decide quedarse en un planeta, pero a Crichton no le parece que esté en sus cabales. Zhaan se une a D’Argo y también se comporta de manera extraña, así que decide ir rescatarlos. Sun y Rygel deben hacer frente a una enfermedad que padece el segundo. abril 1999 · 50 min
E07 · Técnica pacificadora En su viaje por los Territorios Inexplorados Moya encuentra una nave Comando Pacificadora abandonada. Rygel la reconoce como la Celbinion, una reliquia de gran importancia histórica, donde fue torturado durante años. Mientras la investigan se topan con una Pacificadora en su interior y aparece una peligrosa raza que quiere tomar partido del saqueo. mayo 1999 · 50 min
E08 · La vieja magia negra En la visita a un planeta un mago atrapa a Crichton y mediante sus poderes lo enfrenta en ilusiones al Capitán Crais. Los demás deben averiguar los motivos de dicho secuestro y la forma de recuperar a Crichton. junio 1999 · 50 min
E09 · El científico del ADN Un científico da la posibilidad de hallar los hogares de algunos de los tripulantes de Moya, así que estos se enzarzan en una lucha por conseguir resultados y poner rumbo a su planeta antes que al de los demás. Sun sufre efectos inesperados en las pruebas de ADN para identificar las especies. junio 1999 · 50 min
E10 · Tienen un secreto D’Argo sufre un accidente y comienza a tener alucinaciones donde recuerda cosas de su pasado: su relación amorosa con una Pacificadora, los crímenes que se le imputan (su asesinato), su hijo desaparecido… Moya actúa de forma muy extraña, volviéndose incluso contra la tripulación. Al final descubren que un proyecto secreto Pacificador que estaba bloqueado ha sido desbloqueado por accidente, y Moya, que es una nave viva, ha quedado embarazada. junio 1999 · 50 min
E11 · Hasta que la sangre se aclare En una parada en un planeta para estudiar agujeros de gusano, Sun y Crichton descubren que hay órdenes de búsqueda contra los tripulantes de Moya que atraen a cazarrecompensas. julio 1999 · 50 min
E12 · Rapsodia azul Un grupo de la raza de Zhaan atrae a Moya hacia el planeta donde se encuentran. Pronto se descubre que las intenciones de algunos no son amistosas, y además se da a conocer el oscuro pasado de Zhaan. julio 1999 · 50 min
E13 · El rastrillo Aeryn y Crichton quedan atrapados en una trampa mientras los demás deben lidiar con los piratas que la han preparado. julio 1999 · 50 min
E14 · Jeremiah Crichton Crichton se queda abandonado durante varios meses en un planeta con unos colonos. Cuando los compañeros de Moya consiguen encontrarle la paz se rompe. julio 1999 · 50 min
E15 · Durka vuelve Tras un accidente Moya recoge a unos supervivientes entre los que está el mítico Durka, aquél que torturo a Rygel durante mucho tiempo, además de una prisionera de raza Nebari. A pesar de que Durka parece transformado Rygel intenta acabar con su vida… y en el proceso despierta de nuevo al terrible Pacificador. agosto 1999 · 50 min
E16 · Una reacción humana Ante Moya se abre un agujero de gusano desde donde se vislumbra la Tierra. Crichton se lanza a través de él, pero el recibimiento en su supuesto hogar no es el esperado. julio 1999 · 50 min
E17 · A través del espejo La realidad en Moya se ve truncada, dividida en tres, y algunas no son agradables para todas las especies. Crichton corre de una a otra realidad intentando arreglar el asunto, pero además hay una criatura peligrosa acechando. septiembre 1999 · 50 min
E18 · Una vida de bichos Deben dejar subir a bordo a unos Pacificadores que van en misión secreta. Cuando el secreto de los mismos se escapa, una criatura va poseyendo a los tripulantes de Moya. septiembre 1999 · 50 min
E19 · Nervio Crichton se ve obligado a infiltrarse en una base militar secreta de los Pacificadores para buscar medicinas para Aeryn Sun. Allí, el terrorífico líder llamado Scorpius sospecha de él y le hace preso. Durante la tortura a la que le somete, Scorpius halla en la mente de Crichton valiosa información sobre los agujeros de gusano; averiguar más se convierte en su objetivo principal. enero 2000 · 50 min
E20 · La memoria oculta La tripulación de Moya intenta rescatar a Crichton. Gelina y un preso llamado Stark también intentan ayudar. Crais aparece en busca de Crichton, pero Scorpius no pretende ceder a su valiosa presa. Mientras, Moya da a luz un bebé leviatán… pero es producto de un experimento Pacificador: está fuertemente armado. enero 2000 · 50 min
E21 · Nacida salvaje Moya se oculta en un campo de asteroides. En uno de ellos hay un jardín botánico donde se encuentran con una peligrosa criatura. Scorpius mina la autoridad de Crais para tomar el mando de su nave y usarla en la persecución de Crichton. Mientras, el bebé de Moya resulta otro problema más, pues está asustado y se rebela contra su madre y quienes intentan entablar contacto con él. enero 2000 · 50 min
E22 · Lazos familiares Rygel desespera ante la persecución a la que son sometidos y huye hacia los Pacificadores para intentar hacer un trato con Scorpius. Sorprendentemente, regresa con un desgraciado Crais, quien ahora se ve forzado a huir también de su propio gobierno. Crichton urde un plan para destruir la base Pacificadora. Crais logra hacerse con el control de Talyn, el bebé de Moya. enero 2000 · 50 min