La segunda temporada se estrenó el 13 de septiembre de 2005 y terminó el 23 de mayo de 2006. Durante la temporada, House trata de lidiar con sus sentimientos hacia su ex-novia Stacy Warner, quien, después de que House diagnostica a su esposo con "porfiria aguda intermitente", acepta un trabajo en el departamento legal del hospital.
La química entre Sela Ward y Laurie en los últimos dos episodios de la primera temporada fue lo suficientemente fuerte como para hacer que el personaje regresara por siete episodios de la segunda. La temporada fue un éxito de audiencias; "No Reason" fue visto por 25,47 millones de espectadores, el número más alto de la historia del programa hasta ese momento.3 La segunda temporada promedió 17,3 millones de espectadores por episodio, superando a la primera por un 30%. Esto la convirtió en el décimo programa más visto en la temporada televisiva 2005–2006.
0/24 vistos
E01 · Aceptaciónseptiembre 2005 · 44 min
E02 · Autopsiaseptiembre 2005 · 44 min
E03 · Humpty Dumptyseptiembre 2005 · 44 min
E04 · Es o no esnoviembre 2005 · 44 min
E05 · El niño de papánoviembre 2005 · 44 min
E06 · Dar vueltasnoviembre 2005 · 44 min
E07 · Caza
Un joven con SIDA, que tiene problemas respiratorios, logra que House lo atienda contra su voluntad.
noviembre 2005 · 44 min
E08 · El errornoviembre 2005 · 44 min
E09 · Engañodiciembre 2005 · 44 min
E10 · Problemas de comunicaciónenero 2006 · 44 min
E11 · Necesidad de saberfebrero 2006 · 44 min
E12 · Distraccionesfebrero 2006 · 44 min
E13 · No es oro todo lo que relucefebrero 2006 · 44 min